Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IST1P53990 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IST1P53990 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IST1P53990 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IST1P53990 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IST1P53990 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IST1P53990 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IST1P53990 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IST1P53990 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IST1P53990 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IST1P53990 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IST1P53990 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IST1P53990 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IST1P53990 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IST1P53990 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IST1P53990 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IST1P53990 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IST1P53990 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IST1P53990 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IST1P53990 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IST1P53990 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IST1P53990 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IST1P53990 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IST1P53990 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IST1P53990 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IST1P53990 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IST1P53990 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IST1P53990 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IST1P53990 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IST1P53990 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IST1P53990 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IST1P53990 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IST1P53990 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IST1P53990 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IST1P53990 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IST1P53990 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IST1P53990 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IST1P53990 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IST1P53990 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IST1P53990 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IST1P53990 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IST1P53990 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IST1P53990 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IST1P53990 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IST1P53990 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IST1P53990 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IST1P53990 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IST1P53990 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IST1P53990 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IST1P53990 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms