Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP98P52948 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NUP98P52948 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
NUP98P52948 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP98P52948 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP98P52948 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP98P52948 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP98P52948 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP98P52948 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP98P52948 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP98P52948 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP98P52948 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP98P52948 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP98P52948 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP98P52948 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP98P52948 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP98P52948 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP98P52948 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP98P52948 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP98P52948 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP98P52948 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP98P52948 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP98P52948 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP98P52948 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP98P52948 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP98P52948 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP98P52948 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP98P52948 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP98P52948 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP98P52948 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP98P52948 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP98P52948 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP98P52948 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP98P52948 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP98P52948 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP98P52948 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP98P52948 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP98P52948 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP98P52948 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP98P52948 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP98P52948 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP98P52948 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP98P52948 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP98P52948 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP98P52948 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP98P52948 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP98P52948 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP98P52948 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP98P52948 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP98P52948 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP98P52948 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP98P52948 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP98P52948 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP98P52948 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP98P52948 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP98P52948 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP98P52948 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP98P52948 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP98P52948 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP98P52948 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP98P52948 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP98P52948 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP98P52948 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP98P52948 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP98P52948 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP98P52948 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP98P52948 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP98P52948 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP98P52948 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP98P52948 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP98P52948 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP98P52948 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP98P52948 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP98P52948 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP98P52948 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP98P52948 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP98P52948 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP98P52948 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP98P52948 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP98P52948 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP98P52948 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP98P52948 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP98P52948 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP98P52948 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP98P52948 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUP98P52948 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP98P52948 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUP98P52948 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP98P52948 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP98P52948 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUP98P52948 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms