Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HK3P52790 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HK3P52790 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HK3P52790 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HK3P52790 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HK3P52790 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HK3P52790 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HK3P52790 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HK3P52790 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HK3P52790 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HK3P52790 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HK3P52790 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HK3P52790 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HK3P52790 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HK3P52790 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HK3P52790 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HK3P52790 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HK3P52790 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HK3P52790 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HK3P52790 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HK3P52790 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HK3P52790 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HK3P52790 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HK3P52790 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HK3P52790 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HK3P52790 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HK3P52790 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HK3P52790 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HK3P52790 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HK3P52790 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HK3P52790 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HK3P52790 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HK3P52790 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HK3P52790 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HK3P52790 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HK3P52790 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HK3P52790 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HK3P52790 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HK3P52790 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HK3P52790 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HK3P52790 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HK3P52790 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HK3P52790 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HK3P52790 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HK3P52790 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HK3P52790 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HK3P52790 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HK3P52790 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HK3P52790 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HK3P52790 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HK3P52790 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HK3P52790 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HK3P52790 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HK3P52790 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HK3P52790 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HK3P52790 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HK3P52790 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HK3P52790 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HK3P52790 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HK3P52790 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HK3P52790 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HK3P52790 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HK3P52790 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HK3P52790 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HK3P52790 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HK3P52790 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HK3P52790 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HK3P52790 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HK3P52790 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HK3P52790 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HK3P52790 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HK3P52790 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HK3P52790 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HK3P52790 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HK3P52790 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HK3P52790 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HK3P52790 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HK3P52790 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HK3P52790 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HK3P52790 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HK3P52790 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HK3P52790 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HK3P52790 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HK3P52790 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HK3P52790 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HK3P52790 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HK3P52790 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HK3P52790 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HK3P52790 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HK3P52790 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HK3P52790 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HK3P52790 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HK3P52790 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HK3P52790 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HK3P52790 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HK3P52790 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HK3P52790 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HK3P52790 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HK3P52790 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HK3P52790 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms