Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR5P51681 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR5P51681 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR5P51681 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR5P51681 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR5P51681 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR5P51681 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR5P51681 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR5P51681 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR5P51681 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR5P51681 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR5P51681 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR5P51681 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR5P51681 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR5P51681 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR5P51681 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR5P51681 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR5P51681 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR5P51681 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR5P51681 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR5P51681 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR5P51681 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR5P51681 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR5P51681 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR5P51681 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR5P51681 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR5P51681 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR5P51681 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR5P51681 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR5P51681 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR5P51681 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR5P51681 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR5P51681 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR5P51681 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR5P51681 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR5P51681 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR5P51681 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR5P51681 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR5P51681 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR5P51681 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR5P51681 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR5P51681 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR5P51681 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR5P51681 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR5P51681 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR5P51681 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR5P51681 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR5P51681 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR5P51681 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR5P51681 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR5P51681 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR5P51681 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR5P51681 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCR5P51681 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR5P51681 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR5P51681 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR5P51681 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR5P51681 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR5P51681 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR5P51681 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR5P51681 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR5P51681 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR5P51681 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR5P51681 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR5P51681 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR5P51681 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR5P51681 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR5P51681 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR5P51681 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR5P51681 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR5P51681 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR5P51681 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR5P51681 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR5P51681 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR5P51681 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR5P51681 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR5P51681 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR5P51681 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms