Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIG4P49917 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIG4P49917 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIG4P49917 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIG4P49917 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIG4P49917 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIG4P49917 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIG4P49917 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIG4P49917 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIG4P49917 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIG4P49917 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIG4P49917 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIG4P49917 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIG4P49917 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIG4P49917 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIG4P49917 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LIG4P49917 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIG4P49917 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIG4P49917 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIG4P49917 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LIG4P49917 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIG4P49917 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIG4P49917 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIG4P49917 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIG4P49917 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIG4P49917 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIG4P49917 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LIG4P49917 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIG4P49917 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIG4P49917 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIG4P49917 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIG4P49917 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LIG4P49917 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIG4P49917 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIG4P49917 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIG4P49917 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIG4P49917 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIG4P49917 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIG4P49917 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LIG4P49917 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG4P49917 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG4P49917 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG4P49917 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIG4P49917 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LIG4P49917 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LIG4P49917 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG4P49917 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG4P49917 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG4P49917 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG4P49917 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG4P49917 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIG4P49917 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG4P49917 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG4P49917 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG4P49917 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG4P49917 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIG4P49917 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG4P49917 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG4P49917 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG4P49917 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG4P49917 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG4P49917 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG4P49917 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LIG4P49917 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG4P49917 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG4P49917 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG4P49917 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG4P49917 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG4P49917 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG4P49917 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LIG4P49917 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIG4P49917 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG4P49917 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG4P49917 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG4P49917 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG4P49917 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG4P49917 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG4P49917 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIG4P49917 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms