Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PXNP49023 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PXNP49023 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PXNP49023 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PXNP49023 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PXNP49023 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PXNP49023 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PXNP49023 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PXNP49023 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PXNP49023 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PXNP49023 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PXNP49023 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PXNP49023 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PXNP49023 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PXNP49023 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PXNP49023 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PXNP49023 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PXNP49023 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PXNP49023 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PXNP49023 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PXNP49023 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PXNP49023 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PXNP49023 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PXNP49023 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PXNP49023 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PXNP49023 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PXNP49023 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PXNP49023 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PXNP49023 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PXNP49023 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PXNP49023 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PXNP49023 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PXNP49023 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PXNP49023 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PXNP49023 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PXNP49023 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PXNP49023 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PXNP49023 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PXNP49023 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PXNP49023 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PXNP49023 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PXNP49023 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PXNP49023 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PXNP49023 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PXNP49023 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PXNP49023 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PXNP49023 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PXNP49023 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PXNP49023 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PXNP49023 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PXNP49023 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PXNP49023 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PXNP49023 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PXNP49023 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PXNP49023 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PXNP49023 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PXNP49023 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PXNP49023 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PXNP49023 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PXNP49023 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PXNP49023 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PXNP49023 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PXNP49023 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PXNP49023 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PXNP49023 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PXNP49023 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PXNP49023 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PXNP49023 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PXNP49023 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PXNP49023 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PXNP49023 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms