Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT5P48643 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT5P48643 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT5P48643 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT5P48643 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT5P48643 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT5P48643 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT5P48643 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT5P48643 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT5P48643 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT5P48643 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT5P48643 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT5P48643 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT5P48643 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT5P48643 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT5P48643 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT5P48643 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT5P48643 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT5P48643 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT5P48643 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT5P48643 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT5P48643 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT5P48643 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT5P48643 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT5P48643 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT5P48643 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT5P48643 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT5P48643 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT5P48643 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT5P48643 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT5P48643 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT5P48643 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT5P48643 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT5P48643 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT5P48643 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT5P48643 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT5P48643 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT5P48643 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT5P48643 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT5P48643 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT5P48643 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT5P48643 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT5P48643 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT5P48643 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT5P48643 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT5P48643 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT5P48643 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT5P48643 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT5P48643 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT5P48643 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT5P48643 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT5P48643 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT5P48643 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT5P48643 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT5P48643 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT5P48643 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT5P48643 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT5P48643 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT5P48643 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT5P48643 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT5P48643 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT5P48643 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT5P48643 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT5P48643 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT5P48643 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT5P48643 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT5P48643 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT5P48643 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT5P48643 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT5P48643 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT5P48643 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT5P48643 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT5P48643 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT5P48643 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT5P48643 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT5P48643 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT5P48643 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT5P48643 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT5P48643 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT5P48643 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms