Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCP4P48539 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCP4P48539 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCP4P48539 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCP4P48539 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCP4P48539 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCP4P48539 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCP4P48539 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCP4P48539 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCP4P48539 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCP4P48539 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCP4P48539 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCP4P48539 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCP4P48539 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCP4P48539 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCP4P48539 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCP4P48539 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCP4P48539 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCP4P48539 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCP4P48539 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCP4P48539 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCP4P48539 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCP4P48539 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCP4P48539 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCP4P48539 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCP4P48539 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCP4P48539 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCP4P48539 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCP4P48539 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCP4P48539 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCP4P48539 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCP4P48539 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCP4P48539 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCP4P48539 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCP4P48539 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCP4P48539 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCP4P48539 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCP4P48539 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCP4P48539 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCP4P48539 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCP4P48539 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCP4P48539 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCP4P48539 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCP4P48539 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PCP4P48539 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCP4P48539 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCP4P48539 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCP4P48539 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCP4P48539 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCP4P48539 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCP4P48539 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCP4P48539 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCP4P48539 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCP4P48539 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCP4P48539 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCP4P48539 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCP4P48539 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCP4P48539 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCP4P48539 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCP4P48539 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCP4P48539 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms