Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NR4A2P43354 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NR4A2P43354 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NR4A2P43354 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms