Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ETV4P43268 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ETV4P43268 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETV4P43268 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETV4P43268 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETV4P43268 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETV4P43268 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETV4P43268 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETV4P43268 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ETV4P43268 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV4P43268 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV4P43268 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV4P43268 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV4P43268 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV4P43268 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV4P43268 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV4P43268 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ETV4P43268 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ETV4P43268 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV4P43268 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV4P43268 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV4P43268 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV4P43268 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV4P43268 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV4P43268 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV4P43268 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ETV4P43268 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV4P43268 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV4P43268 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV4P43268 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV4P43268 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV4P43268 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV4P43268 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV4P43268 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV4P43268 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV4P43268 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV4P43268 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV4P43268 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV4P43268 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV4P43268 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV4P43268 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV4P43268 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV4P43268 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV4P43268 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV4P43268 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV4P43268 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV4P43268 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV4P43268 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV4P43268 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV4P43268 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV4P43268 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV4P43268 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV4P43268 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV4P43268 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV4P43268 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV4P43268 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV4P43268 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV4P43268 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV4P43268 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV4P43268 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV4P43268 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV4P43268 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV4P43268 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV4P43268 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV4P43268 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETV4P43268 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETV4P43268 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETV4P43268 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETV4P43268 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ETV4P43268 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ETV4P43268 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ETV4P43268 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms