Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGIRP43119 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGIRP43119 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGIRP43119 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms