Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER3P43115 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGER3P43115 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER3P43115 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms