Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL5P42830 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms