Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA9P38646 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA9P38646 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA9P38646 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms