Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ZEB1P37275 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ZEB1P37275 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ZEB1P37275 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZEB1P37275 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms