Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP62P37198 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP62P37198 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP62P37198 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP62P37198 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP62P37198 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUP62P37198 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP62P37198 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP62P37198 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP62P37198 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP62P37198 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP62P37198 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP62P37198 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP62P37198 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP62P37198 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP62P37198 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP62P37198 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP62P37198 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP62P37198 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP62P37198 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP62P37198 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP62P37198 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP62P37198 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP62P37198 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP62P37198 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP62P37198 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP62P37198 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP62P37198 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP62P37198 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP62P37198 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP62P37198 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP62P37198 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP62P37198 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP62P37198 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP62P37198 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP62P37198 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP62P37198 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUP62P37198 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP62P37198 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP62P37198 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP62P37198 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP62P37198 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP62P37198 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP62P37198 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP62P37198 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP62P37198 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP62P37198 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP62P37198 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP62P37198 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP62P37198 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP62P37198 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP62P37198 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP62P37198 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP62P37198 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP62P37198 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP62P37198 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP62P37198 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP62P37198 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP62P37198 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP62P37198 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP62P37198 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP62P37198 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP62P37198 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NUP62P37198 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms