Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SREBF1P36956 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SREBF1P36956 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREBF1P36956 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SREBF1P36956 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREBF1P36956 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SREBF1P36956 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREBF1P36956 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms