Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYH11P35749 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYH11P35749 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYH11P35749 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MYH11P35749 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYH11P35749 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYH11P35749 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYH11P35749 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYH11P35749 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYH11P35749 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYH11P35749 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYH11P35749 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYH11P35749 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYH11P35749 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYH11P35749 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYH11P35749 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYH11P35749 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYH11P35749 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYH11P35749 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYH11P35749 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYH11P35749 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYH11P35749 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYH11P35749 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYH11P35749 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYH11P35749 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYH11P35749 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYH11P35749 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYH11P35749 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYH11P35749 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYH11P35749 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYH11P35749 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYH11P35749 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYH11P35749 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYH11P35749 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYH11P35749 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYH11P35749 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYH11P35749 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYH11P35749 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYH11P35749 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYH11P35749 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYH11P35749 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYH11P35749 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYH11P35749 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYH11P35749 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MYH11P35749 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYH11P35749 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYH11P35749 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYH11P35749 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYH11P35749 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYH11P35749 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYH11P35749 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYH11P35749 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYH11P35749 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYH11P35749 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYH11P35749 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYH11P35749 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYH11P35749 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYH11P35749 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYH11P35749 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYH11P35749 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH11P35749 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH11P35749 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH11P35749 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH11P35749 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH11P35749 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH11P35749 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH11P35749 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH11P35749 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH11P35749 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH11P35749 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH11P35749 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH11P35749 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH11P35749 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH11P35749 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH11P35749 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH11P35749 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH11P35749 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH11P35749 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH11P35749 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH11P35749 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH11P35749 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH11P35749 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH11P35749 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH11P35749 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH11P35749 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH11P35749 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYH11P35749 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYH11P35749 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYH11P35749 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYH11P35749 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYH11P35749 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH11P35749 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH11P35749 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH11P35749 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH11P35749 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH11P35749 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH11P35749 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH11P35749 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH11P35749 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH11P35749 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms