Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYLC1P35663 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLC1P35663 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYLC1P35663 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms