Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF2P35227 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCGF2P35227 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF2P35227 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms