Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA1P35221 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA1P35221 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms