Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHRP34981 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHRP34981 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHRP34981 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHRP34981 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHRP34981 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRHRP34981 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHRP34981 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHRP34981 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHRP34981 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHRP34981 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHRP34981 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHRP34981 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHRP34981 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHRP34981 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHRP34981 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHRP34981 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHRP34981 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRHRP34981 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHRP34981 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHRP34981 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHRP34981 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRHRP34981 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHRP34981 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHRP34981 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHRP34981 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHRP34981 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHRP34981 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHRP34981 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHRP34981 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRHRP34981 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRHRP34981 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRHRP34981 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHRP34981 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHRP34981 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHRP34981 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHRP34981 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHRP34981 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHRP34981 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHRP34981 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHRP34981 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHRP34981 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHRP34981 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHRP34981 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHRP34981 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHRP34981 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHRP34981 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHRP34981 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHRP34981 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHRP34981 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHRP34981 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHRP34981 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHRP34981 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHRP34981 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHRP34981 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHRP34981 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHRP34981 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHRP34981 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHRP34981 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHRP34981 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHRP34981 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHRP34981 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHRP34981 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHRP34981 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHRP34981 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHRP34981 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHRP34981 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHRP34981 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRHRP34981 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms