Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYKP34925 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYKP34925 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYKP34925 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYKP34925 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYKP34925 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYKP34925 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYKP34925 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYKP34925 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYKP34925 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RYKP34925 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYKP34925 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYKP34925 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYKP34925 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYKP34925 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYKP34925 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYKP34925 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYKP34925 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYKP34925 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYKP34925 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYKP34925 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYKP34925 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYKP34925 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYKP34925 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYKP34925 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYKP34925 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RYKP34925 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYKP34925 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYKP34925 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYKP34925 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYKP34925 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYKP34925 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYKP34925 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RYKP34925 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYKP34925 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYKP34925 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYKP34925 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYKP34925 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RYKP34925 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RYKP34925 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RYKP34925 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RYKP34925 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYKP34925 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYKP34925 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYKP34925 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYKP34925 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYKP34925 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RYKP34925 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYKP34925 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYKP34925 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYKP34925 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYKP34925 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYKP34925 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYKP34925 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RYKP34925 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms