Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX2P32243 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX2P32243 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX2P32243 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX2P32243 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX2P32243 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX2P32243 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX2P32243 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX2P32243 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTX2P32243 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTX2P32243 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX2P32243 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX2P32243 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX2P32243 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX2P32243 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX2P32243 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX2P32243 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX2P32243 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTX2P32243 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTX2P32243 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTX2P32243 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTX2P32243 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTX2P32243 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTX2P32243 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTX2P32243 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTX2P32243 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTX2P32243 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTX2P32243 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTX2P32243 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OTX2P32243 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTX2P32243 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OTX2P32243 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX2P32243 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX2P32243 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX2P32243 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTX2P32243 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX2P32243 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX2P32243 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX2P32243 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX2P32243 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX2P32243 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTX2P32243 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTX2P32243 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTX2P32243 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTX2P32243 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX2P32243 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX2P32243 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX2P32243 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX2P32243 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTX2P32243 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX2P32243 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX2P32243 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX2P32243 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX2P32243 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX2P32243 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX2P32243 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX2P32243 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTX2P32243 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX2P32243 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX2P32243 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX2P32243 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX2P32243 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTX2P32243 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX2P32243 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms