Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMPK1P30085 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK1P30085 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMPK1P30085 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms