Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN6P29350 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN6P29350 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN6P29350 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms