Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB9P28065 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms