Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR2AP24928 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2AP24928 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms