Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCHP24723 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCHP24723 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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