Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP24386 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP24386 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP24386 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP24386 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP24386 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP24386 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP24386 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP24386 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP24386 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP24386 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP24386 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP24386 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP24386 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP24386 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP24386 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP24386 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP24386 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP24386 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP24386 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP24386 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP24386 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP24386 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP24386 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP24386 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP24386 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP24386 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP24386 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP24386 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP24386 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP24386 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP24386 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP24386 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP24386 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP24386 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP24386 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP24386 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP24386 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP24386 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP24386 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP24386 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP24386 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP24386 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP24386 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP24386 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP24386 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP24386 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMP24386 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMP24386 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms