Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms