Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHCGRP22888 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHCGRP22888 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LHCGRP22888 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms