Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALB2P22676 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALB2P22676 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALB2P22676 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALB2P22676 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALB2P22676 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALB2P22676 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALB2P22676 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALB2P22676 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALB2P22676 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALB2P22676 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALB2P22676 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALB2P22676 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALB2P22676 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALB2P22676 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALB2P22676 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALB2P22676 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALB2P22676 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALB2P22676 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALB2P22676 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALB2P22676 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALB2P22676 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALB2P22676 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CALB2P22676 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALB2P22676 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALB2P22676 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALB2P22676 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALB2P22676 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALB2P22676 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALB2P22676 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALB2P22676 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALB2P22676 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALB2P22676 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALB2P22676 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALB2P22676 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALB2P22676 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALB2P22676 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CALB2P22676 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CALB2P22676 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALB2P22676 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALB2P22676 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CALB2P22676 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALB2P22676 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALB2P22676 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALB2P22676 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALB2P22676 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALB2P22676 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALB2P22676 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALB2P22676 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB2P22676 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB2P22676 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB2P22676 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB2P22676 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALB2P22676 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB2P22676 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB2P22676 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB2P22676 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB2P22676 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB2P22676 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALB2P22676 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB2P22676 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB2P22676 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB2P22676 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB2P22676 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB2P22676 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB2P22676 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALB2P22676 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB2P22676 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALB2P22676 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALB2P22676 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALB2P22676 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms