Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR3P22607 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms