Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB4AP20338 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB4AP20338 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB4AP20338 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms