Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM21P19474 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM21P19474 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1871.2 ms