Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC3P19447 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC3P19447 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC3P19447 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC3P19447 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC3P19447 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC3P19447 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC3P19447 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC3P19447 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC3P19447 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC3P19447 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC3P19447 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC3P19447 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC3P19447 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC3P19447 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERCC3P19447 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC3P19447 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC3P19447 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC3P19447 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC3P19447 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC3P19447 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC3P19447 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC3P19447 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC3P19447 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC3P19447 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ERCC3P19447 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC3P19447 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms