Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELK1P19419 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELK1P19419 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELK1P19419 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELK1P19419 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELK1P19419 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELK1P19419 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELK1P19419 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELK1P19419 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ELK1P19419 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ELK1P19419 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ELK1P19419 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ELK1P19419 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELK1P19419 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELK1P19419 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELK1P19419 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELK1P19419 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELK1P19419 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELK1P19419 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELK1P19419 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELK1P19419 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELK1P19419 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELK1P19419 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELK1P19419 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELK1P19419 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELK1P19419 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ELK1P19419 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELK1P19419 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELK1P19419 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ELK1P19419 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELK1P19419 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELK1P19419 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELK1P19419 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELK1P19419 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELK1P19419 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ELK1P19419 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELK1P19419 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELK1P19419 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELK1P19419 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELK1P19419 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELK1P19419 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ELK1P19419 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELK1P19419 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELK1P19419 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELK1P19419 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELK1P19419 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELK1P19419 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELK1P19419 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELK1P19419 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms