Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB9P17482 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB9P17482 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms