Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF3P17036 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF3P17036 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF3P17036 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF3P17036 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF3P17036 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF3P17036 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF3P17036 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF3P17036 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF3P17036 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF3P17036 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF3P17036 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF3P17036 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF3P17036 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF3P17036 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF3P17036 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF3P17036 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF3P17036 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF3P17036 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF3P17036 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF3P17036 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF3P17036 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF3P17036 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF3P17036 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF3P17036 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF3P17036 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF3P17036 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF3P17036 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF3P17036 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF3P17036 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF3P17036 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms