Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL3L1P16619 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCL3L1P16619 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCL3L1P16619 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms