Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFXP16104 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms