Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV1P15498 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAV1P15498 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAV1P15498 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAV1P15498 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAV1P15498 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV1P15498 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV1P15498 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV1P15498 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV1P15498 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV1P15498 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV1P15498 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV1P15498 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV1P15498 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAV1P15498 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAV1P15498 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAV1P15498 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAV1P15498 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV1P15498 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV1P15498 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV1P15498 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV1P15498 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV1P15498 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV1P15498 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV1P15498 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV1P15498 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAV1P15498 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV1P15498 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV1P15498 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV1P15498 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV1P15498 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAV1P15498 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV1P15498 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV1P15498 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV1P15498 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV1P15498 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV1P15498 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV1P15498 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV1P15498 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV1P15498 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAV1P15498 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAV1P15498 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV1P15498 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV1P15498 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV1P15498 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV1P15498 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAV1P15498 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VAV1P15498 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV1P15498 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV1P15498 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV1P15498 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV1P15498 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV1P15498 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAV1P15498 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAV1P15498 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAV1P15498 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAV1P15498 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAV1P15498 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAV1P15498 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAV1P15498 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAV1P15498 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAV1P15498 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAV1P15498 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAV1P15498 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAV1P15498 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAV1P15498 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAV1P15498 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAV1P15498 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAV1P15498 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAV1P15498 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms