Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA3P15088 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA3P15088 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA3P15088 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA3P15088 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA3P15088 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA3P15088 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA3P15088 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA3P15088 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA3P15088 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA3P15088 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA3P15088 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA3P15088 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA3P15088 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA3P15088 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA3P15088 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA3P15088 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA3P15088 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA3P15088 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA3P15088 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA3P15088 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA3P15088 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA3P15088 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA3P15088 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA3P15088 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA3P15088 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA3P15088 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA3P15088 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA3P15088 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA3P15088 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA3P15088 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA3P15088 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA3P15088 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA3P15088 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA3P15088 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA3P15088 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA3P15088 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA3P15088 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPA3P15088 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPA3P15088 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA3P15088 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA3P15088 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA3P15088 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA3P15088 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA3P15088 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA3P15088 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA3P15088 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA3P15088 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPA3P15088 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPA3P15088 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms