Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC130P13994 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC130P13994 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms