Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF2F2P13984 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2F2P13984 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms