Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH1P12882 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH1P12882 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH1P12882 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH1P12882 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH1P12882 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH1P12882 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH1P12882 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH1P12882 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH1P12882 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH1P12882 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH1P12882 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH1P12882 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH1P12882 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYH1P12882 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYH1P12882 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH1P12882 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH1P12882 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH1P12882 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH1P12882 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH1P12882 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH1P12882 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH1P12882 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH1P12882 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH1P12882 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH1P12882 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH1P12882 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH1P12882 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH1P12882 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH1P12882 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH1P12882 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH1P12882 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH1P12882 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH1P12882 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH1P12882 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH1P12882 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH1P12882 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH1P12882 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH1P12882 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH1P12882 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH1P12882 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH1P12882 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH1P12882 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH1P12882 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH1P12882 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH1P12882 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH1P12882 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH1P12882 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH1P12882 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH1P12882 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH1P12882 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH1P12882 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH1P12882 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH1P12882 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH1P12882 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH1P12882 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH1P12882 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH1P12882 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH1P12882 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH1P12882 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH1P12882 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH1P12882 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH1P12882 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH1P12882 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH1P12882 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH1P12882 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH1P12882 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH1P12882 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH1P12882 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH1P12882 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH1P12882 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH1P12882 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH1P12882 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH1P12882 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms