Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COL11A1P12107 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL11A1P12107 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COL11A1P12107 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL11A1P12107 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms