Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCRP11274 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCRP11274 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCRP11274 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCRP11274 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCRP11274 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BCRP11274 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCRP11274 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BCRP11274 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCRP11274 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCRP11274 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCRP11274 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BCRP11274 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCRP11274 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCRP11274 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCRP11274 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCRP11274 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCRP11274 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCRP11274 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BCRP11274 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCRP11274 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BCRP11274 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCRP11274 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCRP11274 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCRP11274 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCRP11274 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCRP11274 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCRP11274 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCRP11274 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCRP11274 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCRP11274 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCRP11274 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCRP11274 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCRP11274 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCRP11274 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCRP11274 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCRP11274 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCRP11274 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCRP11274 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCRP11274 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCRP11274 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCRP11274 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCRP11274 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCRP11274 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCRP11274 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BCRP11274 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCRP11274 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCRP11274 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCRP11274 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
BCRP11274 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCRP11274 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCRP11274 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCRP11274 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCRP11274 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCRP11274 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCRP11274 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCRP11274 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCRP11274 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCRP11274 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCRP11274 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCRP11274 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCRP11274 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCRP11274 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCRP11274 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCRP11274 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCRP11274 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BCRP11274 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCRP11274 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCRP11274 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCRP11274 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms