Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR2F1P10589 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR2F1P10589 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms